Dans certains cas, des applications tierces peuvent empêcher MediaMonkey pour Android d'afficher des playlists, d'afficher des doublons de playlists existantes ou d'afficher des playlists précédemment supprimées. Voici quelques exemples :
- MediaMonkey synchronise les listes de lecture avec MediaMonkey pour Android, mettant à jour le système d'exploitation Android Media Store
- Une application tierce détecte les listes de lecture sur Android et crée des fichiers de listes de lecture M3U
- MediaMonkey se synchronise à nouveau, en supprimant certaines listes de lecture et en modifiant d'autres, en mettant à jour le Media Store du système d'exploitation Android
- L'application tierce n'est pas au courant des modifications apportées aux listes de lecture et met à jour le Media Store du système d'exploitation Android en fonction des « anciens » fichiers M3U qu'elle a générés précédemment, ce qui fait que MediaMonkey pour Android affiche des listes de lecture incorrectes.
La solution consiste à désactiver l'option « Mettre à jour les playlists depuis d'autres applications » dans les options de MediaMonkey pour Android. D'autres solutions consistent à resynchroniser avec l'option « Supprimer les fichiers/playlists ne figurant pas dans la liste de synchronisation » activée ou à supprimer toute application tierce présentant ce comportement.